重光堂被空投炸弹击中并摧毁，日军驻上海司令部立刻向日本发去了紧急电报，日本当局得知核心据点被炸、且多名高官与士兵伤亡的消息后，当即陷入暴怒与慌乱中，随即调遣了新的驻上海军官，并严厉要求在上海驻扎的军队以最狠厉的手段压制反抗、稳定局势。

首要之举便是封锁与清查。

日军迅速调动大批宪兵、巡逻队，将重光堂周边三条街区彻底封锁，拉起铁丝网，严禁任何人员出入，除了宪兵队的车辆外均不允许进入，同时法医与情报人员连夜进驻废墟，一方面清理尸体、统计伤亡。

刚签订完合约的高宗武惨死，影佐祯昭的双腿被坍塌的墙体压住，无法逃脱，最终被燃起的火焰烧死，今井武夫重伤送医救治，土肥原贤二目前失踪（实则被废墟掩埋）。

畑俊六的运气好一些，虽然被爆炸的气浪掀飞晕倒，但却没有受多严重的伤，被救出后很快醒来开始指挥后续的工作。除此之外，还有数百名士兵和十几名中下军衔的军官死亡。

苏醒后的畑俊六第一时间督办此事。技术人员对残留物进行细致分析，最终认定袭击所用的是四枚九八式250千克航空爆破弹——这正是日军空军空袭的主力弹种。可棘手的是，炸弹残片上并未找到序列号，根本无法确定这批弹药归属哪一支空军队伍。

技术人员进一步推演投弹轨迹：轰炸机通常在1000-3000米高度投弹，高度越高，炸弹落地前的散布范围越大。而此次四枚炸弹的落地偏差不超过2米，精准度堪称惊人，由此完全可以断定，投弹飞机的飞行高度绝不会超过1200米。

这个结论让畑俊六暴跳如雷。如此低的飞行高度，又是在万里无云的清晨，天空一览无余，怎么可能没有一个守兵察觉飞机的踪迹？难不成驻守上海的日军，全都是睁眼瞎不成？

调查迟迟未有眉目，畑俊六为线索中断而暴怒，在得知早晨曾有大批学生聚集游行，抗议“重光堂尸体”示众一事后，当即下令将矛盾点转移到这些学生身上——既想借机泄愤，也意图用“镇压抗日学生”的姿态稳住局势。

紧接着，日军便以“清查抗日分子”为借口，大批士兵分成若干小队，在上海租界内外展开地毯式搜捕，其中华人商铺成了重点排查目标。

临街的华人商铺首当其冲，日军士兵一脚踹开木门，货架被粗暴推倒，商品散落一地，店主要是敢上前阻拦，便会遭到枪托猛击，轻则口鼻流血，重则被直接拖拽至街面，扣上通共通重庆的嫌疑抓捕。

一时间，街头随处可见日军破门而入、拖拽抓捕的残暴场景。

尤其是那些临街的商户，因恰好目睹了清晨学生游行的全过程，便成了日军重点逼问的对象，日军逼他们指认游行学生的领头人相貌，但凡有商户面露难色或是摇头说不知情，便会遭到残酷用刑，只有配合给出供词的人才能逃过一劫。

仅仅一个下午，不少正在课堂上听课的学生，就被突然闯入的日军强行带走。他们中有的确实参与过游行，有的却只是因为名字被人胡乱供出，便平白遭了无妄之灾。